Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms