Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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BC048679D3YXE9 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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