Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Trabd2bB1ATG9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Trabd2bB1ATG9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Trabd2bB1ATG9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms