Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms