Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac5Q9Z2V6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms