Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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TapbpQ9R233 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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TapbpQ9R233 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TapbpQ9R233 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TapbpQ9R233 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TapbpQ9R233 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TapbpQ9R233 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TapbpQ9R233 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TapbpQ9R233 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TapbpQ9R233 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TapbpQ9R233 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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