Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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