Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ybx3Q9JKB3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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