Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nop56Q9D6Z1 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nop56Q9D6Z1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nop56Q9D6Z1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nop56Q9D6Z1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nop56Q9D6Z1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nop56Q9D6Z1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nop56Q9D6Z1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nop56Q9D6Z1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nop56Q9D6Z1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nop56Q9D6Z1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nop56Q9D6Z1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Nop56Q9D6Z1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Nop56Q9D6Z1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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