Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgms2Q9D4B1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms