Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpusd4Q9CWX4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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