Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gins4Q99LZ3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms