Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rcbtb2Q99LJ7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms