Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms