Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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