Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hecw1Q8K4P8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms