Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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