Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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LgsnQ8CIX8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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LgsnQ8CIX8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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LgsnQ8CIX8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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LgsnQ8CIX8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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LgsnQ8CIX8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LgsnQ8CIX8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LgsnQ8CIX8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms