Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Card11Q8CIS0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms