Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx17Q8BVL3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms