Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdcl3Q8BVF2 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.4 ms