Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssc5dQ8BV57 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms