Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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Smim19Q80ZU4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Smim19Q80ZU4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Smim19Q80ZU4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Smim19Q80ZU4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Smim19Q80ZU4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Smim19Q80ZU4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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