Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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