Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms