Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PatjQ63ZW7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PatjQ63ZW7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PatjQ63ZW7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PatjQ63ZW7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PatjQ63ZW7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PatjQ63ZW7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PatjQ63ZW7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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