Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mre11Q61216 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms