Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkrn3Q60764 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms