Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT2

Psd, PH and SEC7 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsdQ5DTT2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PsdQ5DTT2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PsdQ5DTT2 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PsdQ5DTT2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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PsdQ5DTT2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PsdQ5DTT2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PsdQ5DTT2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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PsdQ5DTT2 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PsdQ5DTT2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsdQ5DTT2 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms