Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rbm44Q3V089 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rbm44Q3V089 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm44Q3V089 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms