Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rnf224Q3UIW8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rnf224Q3UIW8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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