Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp39Q3TIX9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms