Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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