Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ttc39dQ0VF76 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc39dQ0VF76 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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