Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubxn2bQ0KL01 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms