Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf541Q0GGX2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf541Q0GGX2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms