Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms