Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Tff1Q08423 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Tff1Q08423 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Tff1Q08423 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Tff1Q08423 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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