Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Sh3bp2Q06649 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp2Q06649 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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