Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Top2aQ01320 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms