Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms