Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bop1P97452 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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