Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2nP61089 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms