Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GferP56213 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GferP56213 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GferP56213 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms