Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rrp1P56183 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrp1P56183 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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