Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TspoP50637 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms