Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hoxc13P50207 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hoxc13P50207 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hoxc13P50207 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hoxc13P50207 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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