Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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