Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VdrP48281 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VdrP48281 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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