Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NodalP43021 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NodalP43021 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms